Le professeur Pierre Aronnax, son domestique Conseil, et le harponneur canadien Ned Land, après avoir essayé d'attraper un monstre marin mystérieux, se retrouvent prisonniers sur le sous-marin du capitaine Nemo, Nautilus. Nos héros vont passer par d'innombrables aventures: découvriront des trésors dans l'Atlantide et des épaves antiques perdus; s'aventureront dans les îles du Pacifique et sur la banquise du pôle Sud; chasseront dans les forêts sous-marines et se battront contre des calamars géant. Mais leur objectif sera de s’échapper du sous-marin du capitaine Nemo, qui veut les garder enfermés pour toujours.